1988.8-1992.7  山东大学  微生物学  学士

1994.8-1997.7  中国科学院武汉病毒所  微生物学  硕士

2002.7-2005.7  新加坡国立大学  微生物学  博士

1992.8-1994.7  安徽省工商局质检科  技术员

1997.9-2000.7  中国科学技术大学  生命科学学院  讲师

2000.9-2002.7  美国南加州大学  访问学者

2006.8-2009.7  暨南大学生命科学学院  副教授

2009.8-2010.7  日本长崎大学  客座研究员

2010.8-至今  中国科学院水生生物研究所 研究员 水生生物蛋白质组学科组组长  博士生导师

遗传学（硕士生，博士生）

目前的研究兴趣主要集中在：

1. 蛋白质翻译后修饰组学及其功能研究；

2. 重要模式生物的蛋白基因组学(Proteogenomics)分析；

3. 非编码RNA与蛋白质相互作用网络及其调控机制

1.      国家重点研发计划，2016YFA0501304，蛋白质组精准鉴定搜索引擎及技术体系，2016.7-2021.6，537万元，在研，课题负责人；

2.      国家自然科学基金面上项目，31870756，长链非编码RNA HOTAIR与YBX1（Y-box protein-1）蛋白相互作用调控肿瘤细胞增殖的分子机制研究，2019.1-2022.12，78万元，在研，课题负责人；

3.      中国科学院前沿科学重点研究项目，QYZDY-SSW-SMC00402，蓝细菌环境适应性的功能蛋白质组学研究，2016.9-2021.12，250万元，在研，课题负责人；

4.      中国科学院科研仪器设备研制项目，YJKYYQ20200051，基于微纳流控芯片的单细胞蛋白质组学分析系统研制，2021.1-2022.12，300万元，在研，项目负责人；

5.      武汉市应用基础前沿项目，20190207101143，真核生物的蛋白基因组学分析软件的开发和推广，2019.9-2021.12，50万元，在研，课题负责人；

6.      国家自然科学基金面上项目，31570829，蓝藻的琥珀酰修饰组及其在光合作用中的功能和分子调控机制研究，2016.1-2019.12，80万元，结题，课题负责人；

7.      中国科学院战略性先导科技专项（B类），XDB14030202，环境污染物微囊藻毒素致毒的分子机制研究，2014.7-2019.7，281万元，结题，课题负责人；

8.      国家自然科学基金重大研究计划，91540102，超高分辨成像技术研究细胞内长链非编码RNA-HOTAIR与蛋白质相互作用，016.1-2018.12，96万元、已结题、课题负责人；

9.      国家自然科学基金面上项目，31370746，长链非编码RNA-HOTAIR的蛋白调控网络的构建及功能研究，2014.1-2017.12，80万元，已结题，课题负责人；

10.   国家重点基础研究发展计划（973 计划）项目，2012CB518703，非编码RNA-蛋白相互作用调控病原菌侵入及胞内存活的分子机制研究，2012.1-2016.12，376万元，已结题，课题负责人；

11.   中国科学院领域前沿研究项目，Y05102，蓝藻的信号组学研究、2010.9-2013.12，200万元，已结题，课题负责人。

多年来从事功能蛋白质组学领域相关的研究工作，首次完成并报道了模式蓝藻和硅藻的蛋白质组精细图谱，建立了完整的适用于各种已经测序的模式生物蛋白基因组学分析流程；发展了基于质谱的蛋白质翻译后修饰的鉴定技术，建立了水生模式生物中蛋白质翻译后修饰的大规模、系统发现的技术方法；揭示了水生模式生物中磷酸化、乙酰化、琥珀酰化等重要蛋白质翻译后修饰在光合作用及能量代谢过程中的功能及其分子作用机制；采用定量蛋白质组学结合功能研究揭示了水生模式生物适应高光和缺氮等逆境的分子机制及关键蛋白分子；开创了水生生物功能蛋白质组学这一新的研究领域，解决了水生生物学研究中的一些重大科学问题。

代表性论文（*：通讯作者）：

1. Lin X, Yang M, Liu X, Cheng Z, Ge F*. Characterization of Lysine Monomethylome and Methyltransferase in Model Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2020 Oct 29:S1672-0229(18)30224-9.

2. Liu X, Yang M, Liu Y, Ge F*, Zhao J*. Structural and Functional Insights into a Lysine Deacylase in the Cyanobacterium Synechococcus sp. PCC 7002. Plant Physiology. 2020 Oct;184(2):762-776.

3. Yang MK, Yang YH, Chen Z, Zhang J, Lin Y, Wang Y, Xiong Q, Li T*, Ge F*, Bryant DA, Zhao JD. Proteogenomic analysis and global discovery of posttranslational modifications in prokaryotes. PNAS. 2014 Dec 30;111(52):E5633-42.

4. Yang M, Lin X, Liu X, Zhang J, Ge F*. Genome Annotation of a Model Diatom Phaeodactylum tricornutum Using an Integrated Proteogenomic Pipeline. Molecular Plant. 2018 Oct 8;11(10):1292-1307. （封面论文）

5. Wu Y, Xiong Q, Li S, Yang X, Ge F*. Integrated Proteomic and Transcriptomic Analysis Reveals Long Noncoding RNA HOX Transcript Antisense Intergenic RNA (HOTAIR) Promotes Hepatocellular Carcinoma Cell Proliferation by Regulating Opioid Growth Factor Receptor (OGFr). Molecular and Cellular Proteomics. 2018 Jan;17(1):146-159.

6. Chen Z, Zhang G, Yang M, Li T, Ge F*, Zhao J*. Lysine Acetylome Analysis Reveals Photosystem II Manganese-stabilizing Protein Acetylation is Involved in Negative Regulation of Oxygen Evolution in Model Cyanobacterium Synechococcus sp. PCC 7002. Molecular and Cellular Proteomics. 2017 Jul;16(7):1297-1311.

7. Zhang J, Yang MK, Zeng H, Ge F*. GAPP: A Proteogenomic Software for Genome Annotation and Global Profiling of Post-translational Modifications in Prokaryotes. Molecular and Cellular Proteomics. 2016 Nov;15(11):3529-3539.

8. Zheng P, Xiong Q, Wu Y, Chen Y, Chen Z, Fleming J, Gao D, Bi L, Ge F*. Quantitative Proteomics Analysis Reveals Novel Insights into Mechanisms of Action of Long Noncoding RNA Hox Transcript Antisense Intergenic RNA (HOTAIR) in HeLa Cells. Molecular and Cellular Proteomics. 2015 Jun;14(6):1447-63.

9. Xiong Q, Feng J, Li ST, Zhang GY, Qiao ZX, Chen Z, Wu Y, Lin Y, Li T, Ge F*, Zhao JD*. Integrated transcriptomic and proteomic analysis of the global response of Synechococcus to high light stress. Molecular and Cellular Proteomics. 2015 Apr;14(4):1038-53.

10. Yang M, Wang Y, Chen Y, Cheng Z, Gu J, Deng J, Bi L, Chen C, Mo R, Wang X, Ge F*. Succinylome analysis reveals the involvement of lysine succinylation in metabolism in pathogenic Mycobacterium tuberculosis. Molecular and Cellular Proteomics. 2015 Apr;14(4):796-811.

中国科学院“百人计划”入选者（2010年）；

第十四届湖北省自然科学优秀学术论文一等奖（2012年）；

武汉市3551人才（2015年）；

中国科学院大学—BHPB导师科研奖（2014年）；

中国科学院武汉教育基地“优秀研究生导师”（2018年）；

湖北省自然科学二等奖（排名第一）（2019年）；

中国科学院武汉教育基地“优秀研究生导师”（2021年）

湖北省生化及分子生物学会常务理事；中国蛋白质组学会理事；国际专业杂志Journal of Proteome Research，Current Proteomics学术编辑；国家重点研发计划“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项会评专家；国家重点研发计划“精准医学研究”重点专项绩效评审专家；湖北省“百人计划”评审专家。

欢迎对蛋白质组学和蓝藻分子生物学有兴趣的考生报考。