2008-09至2015-06，中国科学院水生生物研究所  水生生物学，博士（硕博连读）

2002-09至2006-06，武汉大学 生命科学学院  本科

2025-01至今            中国科学院水生生物研究所        副研究员

2023-01至2024-12      中国科学院水生生物研究所      项目副研究员 

2021-04至2022-12      中国科学院水生生物研究所      助理研究员 

2019-01至2020-01   美国西北大学     生化与遗传系    访问学者

2015-09至2020-12   华中农业大学     动物科技学院-动物医学院   博士后

水生生物学（硕士生）

1. 脊椎动物适应极端环境的分子机制：

结合基因组、三维基因组、转录组、表观修饰、蛋白组、代谢组等多组学数据以及分子生物学实验验证，揭示鱼类对于深海适应的共性和特性。

2. 基于“万种鱼基因组计划”解析脊椎动物重大性状的遗传机制。

在“万种鱼基因组计划”框架下，解析脊椎动物重大性状的遗传机制，特别是硬骨鱼类的分类地位、演化历程和关键特征的形成机制

3.新基因的起源，演化及其功能研究

以新基因立足点，探讨遗传变异在促进生物的适应进化和生物多样性方面的作用，为遗传育种提供新的分子基础。

4.基于人工智能和大数据分析，建立环境DNA监测平台和长江水产品溯源平台

建立水生生物环境DNA监测平台，实现对鱼类的种类、相对丰度、多样性、濒危种和入侵物种的监测；搭建长江流域水产品查证溯源数据平台，结合人工智能识别模块，实现长江流域重要非法捕捞渔获物的查验、甄别及溯源在线查证功能，构建全面的“长江禁渔执法”数据支撑体系。

1.   2025,03-2028.03，海南省重点研发项目，ZDYF2025GXJS149，海南石斑鱼遗传种质提升和疫病防控技术装备的创新研究，535万，项目骨干

2.   2023.01-2027.12，国家自然科学基金重大项目，32293252，鱼类远缘杂交形成可育品系的遗传规律研究，450万，项目骨干

3.   2022.01-2025.12，国家自然科学基金面上项目，32170438，东亚特有鲤科鱼类新基因的起源、演化及其环境适应性的研究，55万，主持

4.   2022.10-2025.10, 国家重点研发计划，2022YFF0608204，长江流域水产品查证溯源数据平台构建及应用，169万，项目骨干

5.   2021.11-2024.11，基地与人才专项，2021000292，伊犁河谷水生生物和野生动物多样性及保护对策，266万，项目骨干

6.   2019.01-2022.12，国家自然科学基金面上项目，31872322，新发现的LncRNATCONS_00323213基因的表达规律及其对猪骨骼肌卫星细胞分化与骨骼肌发育的表观遗传调控，已结题，项目骨干

7.   2017.01-2019.12，国家自然科学基金青年科学基金项目，31601859，反转座嵌合新基因Chi获得新功能的分子机制的研究，已结题，主持

8.   2016.01-2017.12, 中国博士后科学基金面上项目，2016M592344，反转座嵌合新基因的起源进化及其功能研究，已结题，主持

依托“万种鱼基因组计划”, 团队率先整合人工智能与大数据解析技术，融合功能基因组、三维基因组、表观修饰组、代谢组及深度分子生物学等多维策略，系统解析脊椎动物重大性状演化的遗传机制，揭示遗传变异如何驱动适应性辐射与生物多样性形成，并为现代遗传育种提供新的理论框架与分子靶标。相关成果已在Cell，The Innovation，National Science Review，Molecular Biology and Evolution, Science China Life Science，Journal of Genetics and Genomics等国际经典期刊上发表了SCI论文30余篇。

代表性论文（第一作者#或通讯作者*）

1.        Xu H^#, Fang C^#, Xu W^#, Wang C^#, Song Y^#, Zhu C, Fang W, Fan G, Lv W, Bo J, Zeng H, Sha Z, Liu H, Jing H, Liu H, Wei T, Li J, He L, Cai S, Gan X, Chen Y, Zhang H^*, Wang K^* & He S^*. (2025) Evolution and genetic adaptation of fishes to the deep sea, Cell. 188, 1393-1408 e13.

2.        Xu H^#, Fang C^#, Wang C, Gan X & He S^*. (2024) Lipidome and proteome analyses provide insights into Mariana Trench Snailfish (Pseudoliparis swirei) adaptation to the hadal zone, Water Biology and Security.

3.        Chen J, Zeng H, Lv W, Sun N, Wang C, Xu W, Hu M, Gan X, He L, He S^*& Fang C^*. (2023) Pseudo-chromosome-length genome assembly for a deep-sea eel Ilyophis brunneus sheds light on the deep-sea adaptation, Sci China Life Sci. 66, 1379-1391.

4.        Sun N, Wang C, Lv W, Gan X, Yang L, He S^*& Fang C^*. (2023) 3D landscape reorganization in response to feeding preferences adaptation in the youngest split Gymnocypris fish, J Genet Genomics. 50, 289-292

5.   陈凯^#, 方成池^#, 吴志刚^#, 熊凡, 俞丹, 崔永德, 张琪, 王宝强, 姜传奇, 宋立荣, 等. 2022. AeDNA: 水生生物eDNA数据库.水生生物学报. 46(11): 1741-1747.

6.        Fang C^#, Gan X, Zhang C & He S^*. (2021) The new chimeric chiron genes evolved essential roles in zebrafish embryonic development by regulating NAD(+) levels, Sci China Life Sci. 64, 1929-1948.

7.        Liu X, Zeng H, Wang C, Bo J, Gan X, Fang C^*, He S^*. 2021. Improved genome assembly of Chinese sucker (Myxocyprinus asiaticus) provides insights into the identification and characterization of pharyngeal teeth related maker genes in Cyprinoidei. Water Biology and Security.

8.        Fang C^#, Zou C, Fu Y, Li J, Li Y, Ma Y, Zhao S, Li C. 2018. DNA methylation changes and evolution of RNA-based duplication in Sus scrofa: based on a two-step strategy. Epigenomics 10:199-218.

9.        Li Y^#, Fang C^#, Fu Y, Hu A, Li C, Zou C, Li X, Zhao S, Zhang C, Li C. 2018. A survey of transcriptome complexity in Sus scrofa using single-molecule long-read sequencing. DNA Res 25:421-437

10.    Fang C^#, Guan L, Zhong Z, Gan X, He S. 2015. Analysis of the nicotinamide phosphoribosyltransferase family provides insight into vertebrate adaptation to different oxygen levels during the water-to-land transition. FEBS J 282:2858-2878

申报专利如下：

1. 一种用于检测长吻鮠的特异性引物组、探针及其应用，CN118127173A，2024,发明专利

2. 一种同步检测青鱼和团头鲂的特异性引物组、探针及应用，CN118086525A，2024,发明专利

3.  一种用于检测黄鳝的特异性引物组、探针及其应用，CN118086524A，2024,发明专利

4.  一种多功能背负式野外水体调查采样设备及其使用方法，CN117213922A，2023,发明专利

5.  一种滤饼夹持与泄压装置及系统，CN117125776A，2023,发明专利

湖北省动物学会秘书长

欢迎有生物学、遗传学、生物信息学背景的考生报考。